公益財団法人食品農医薬品安全性評価センター（以下、安評センター）からの推薦依頼に基づき、2013年度（望月喜多司賞として第28回）より日本毒性学会内に設置した望月喜多司記念賞選考小委員会において、食品、農薬、医薬品等の安全性の分野で功績のあった日本毒性学会会員（会員歴10年以上）の受賞候補者から各年度1名を選考し、安評センターに推薦してきた。受賞者は学術年会中の総会における望月喜多司記念賞授賞式において安評センターの代表者より表彰された。しかし、2018年4月に安評センターは財団法人としては解散し、それに伴って同賞も廃止することとなった。
2013年度から2018年度までの受賞者は以下のとおりである。